Создание Республиканского специализированного центра Педиатрии предусматривает соблюдение преемственности при оказании квалифицированной медицинской помощи детям с учетом управленческой вертикали, в основе которой лежит непрерывное наблюдение за ребенком с рождения и в течение последующих жизненных циклов до 18 лет.  Центр является головным учреждением педиатрической службы Республики. Направлениями деятельности Центра являются оказание специализированной помощи детскому населению республики, проведение научных исследований  в области педиатрии, организационно-методическая работа поповышению качества медицинской помощи детскому населению на всех уровнях ее оказания путем координации и мониторинга деятельности 13 региональных детских многопрофильных медицинских центров, оказания  шефской и консультативной помощи в регионах страны. Учитывая потребность населения республики в квалифицированной специализированной медицинской помощи,  за последние 3 года расширилась деятельность Центра: созданы новые подразделения клиники, а именно:

Патология новорождённых, Кардиоревматология, Нефрология,Неврология,Детская хирургия, Врожденные и приобретенные ЛОР заболевания.